| Chromosome (16) |  |
| Gène (87) | |
| Génome (49) | |
| Patrimoine génétique (7) | |
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ainsi que pour déterminer une empreinte génétique. Les scientifiques étudient d'autres bactéries présentes dans le Yellowstone dans l'espoir de trouver de nouveaux remèdes et traitements médicamenteux 99
ou activant plusieurs dizaines de gènes 110,111. Ceci devrait aider à mieux comprendre certains effets (sur les gènes) du réchauffement climatique
Le Comité économique et social européen dans son avis 112 du 3 février 2009 note que des études comparatives concluent à un bilan de l'agriculture bio en moyenne meilleur (au regard de la consommation de matières premières et d'énergie et au regard
ou activant plusieurs dizaines de gènes 110,111. Ceci devrait aider à mieux comprendre certains effets (sur les gènes) du réchauffement climatique
Le Comité économique et social européen dans son avis 112 du 3 février 2009 note que des études comparatives concluent à un bilan de l'agriculture bio en moyenne meilleur (au regard de la consommation de matières premières et d'énergie et au regard
Ce rapport insiste sur la nécessité de protéger la diversité des gènes, des espèces et de l'ensemble des écosystèmes naturels terrestres et aquatiques,
certains craignent une pollution génétique en cas de transmission du gène, ou un impact sur la faune et le sol forestier via la toxine BT émise par ces arbres
Elles permettent la migration d'individus et la circulation de gènes (animaux, végétaux ou fongiques) d'une sous-population à l'autre 3
ou restaurent les flux d'espèces et de gènes qui sont vitaux pour la survie des espèces et leur évolution adaptative.
Les animaux, les plantes ou les gènes doivent se déplacer pour se perpétuer. Pour chaque espèce et parfois pour certaines communautés d'espèces, il est vital que les individus
ou de leurs gènes. L'ensemble enchevêtré de ces corridors constitue la trame d'un maillage écologique;
ou interdisent le déplacement normal et nécessaire de la faune et de la flore, des gènes au sein des espèces et de leurs habitats, particulièrement pour les migrateurs.
qui concentrent et orientent certains flux migratoires et de gènes Les littoraux, cours d'eau, fossés et cordons boisés
La circulation des gènes d'organismes génétiquement modifiés a fait l'objet d'études sur la dispersion autour de champs,
en considérant la diversité des écosystèmes, des espèces, des populations et celle des gènes dans l'espace et dans le temps,
La diversité génétique, elle se définit par la variabilité des gènes au sein d'une même espèce ou d'une population.
Selon les néo-darwinistes, le gène est l'unité fondamentale de la sélection naturelle, donc de l'évolution,
Les biologistes accordent une importance croissante à la diversité génétique et à la circulation des gènes.
nul ne peut savoir quels gènes seront les plus importants pour l'évolution. Il y a donc consensus sur le fait
et interconnectés pour que les échanges de gènes restent possibles Certains considèrent cette approche comme parfois inadéquate et trop restrictive,
ou banales, la biodiversité continue à régresser au niveau des écosystèmes, des espèces, des populations et des gènes en Europe 20
La conservation de gènes dans des banques de semence est un exemple de conservation ex situ,
xix+585 p. ISBN 0-412-47240-6) Michel Chauvet et Louis olivier, La Biodiversité enjeu planétaire, Préserver notre patrimoine génétique, Sang de la Terre, Paris, 1993,416 p
c'est-à-dire l'introduction d'espèces ou de gènes dans un biotope d'où ils étaient absents (p. ex. rat musqué ou OGM) ou de pollution par des gaz à effet de serre tels que le gaz carbonique ou le méthane,
et l'acquisition d'une anomalie chromosomique connue pour être l'une des étapes initiales de certains cancers
fréquence, nombre et dominance des gènes de résistance, expression et interaction de ces gènes, sélection antérieure par d'autres matières actives, degré d'intégration du gène résistant et de la valeur adaptative.
en diluant les gènes de résistance dans la population. la dominance des gènes de résistance:
entrainant une dominance fonctionnelle du gène résistant. modifier Stratégie de limitation de la résistance Rappelons que l'augmentation de dose appliquée ne fait qu'accroitre la pression de sélection.
qu'à éliminer les migrants sensibles susceptible de diluer les gènes de résistance. Il faut donc jouer sur les facteurs opérationnels
Chaque bactérie a un génome lui permettant de dégrader tel ou tel polluant. La souche 195 de Dehalococcoides éthenogenes déchlore de façon réductive le tétrachloroéthène (PCE) et le trichloroéthène (TCE) en chlorure de vinyle (ce qui n'est quand même pas bon pour l'environnement) eten-éthène
Elle cherche à résoudre certains problèmes de la culture, dans ses relations au non-humain, dans sa relation aux temps courts et longs des gènes et de l'évolution.
Importance des bactéries dans l'industrie et les technologies 11 Classification et Identification 11.1 Classification phénotypique 11.2 Chimiotaxonomie 11.3 Classification moléculaire 11 4 Identification des
Les bactéries possèdent un chromosome sous forme de filament d'ADN, support de l'hérédité. Le chromosome bactérien est en général circulaire.
En plus de cet ADN génomique, les cellules bactériennes contiennent souvent des molécules d'ADN circulaire extrachromosomiques appelées plasmides.
La division bactérienne est précédée par la duplication du chromosome bactérien grâce à la réplication de l'ADN
La plupart des bactéries possèdent un unique chromosome circulaire. Il existe toutefois de rares exemples de bactéries,
comme Rhodobacter sphaeroides possédant deux chromosomes. Les bactéries du genre Borrelia ont la particularité d'avoir un génome linéaire
et segmenté, ce qui est exceptionnel chez les procaryotes. La taille du génome peut être très variable selon les espèces de bactéries étudiées.
Le génome de la souche de Escherichia coli séquencé en 1997 est constitué de 4, 6 Mpb (4 600 000 paires de bases),
il code 4 200 protéines. Le génome d'une autre souche de E coli séquencé en 2001 comprend 5
5 Mpb codant 5 400 protéines. Certaines bactéries présentent un tout petit génome, comme la bactérie parasite Mycoplasma genitalium avec un génome de 580 000 paires de bases et la bactérie endosymbiotique d'insecte, Candidatus Carsonella ruddii avec un génome de seulement 160 000 paires de bases
35. Au contraire, la bactérie du sol Sorangium cellulosum possède un génome constitué de 12 200 000 paires de bases 36.
Chose peu commune, les Spirochètes ainsi que des Streptomyces présentent la particularité d'avoir un chromosome linéaire 37
Les bactéries contiennent également souvent un ou plusieurs plasmides, qui sont des molécules d'ADN extrachromosomique.
Ces plasmides peuvent conférer certains avantages aux bactéries, comme la résistance à des antibiotiques ou des facteurs de virulence.
Ils se répliquent indépendamment du chromosome. Le chromosome bactérien peut d'autre part intégrer de l'ADN de virus bactérien (bactériophage).
Ces bactériophages peuvent contribuer au phénotype de l'hôte 38. Par exemple, les bactéries Clostridium botulinum et Escherichia coli o157:
H7 synthétisent une toxine codée par un gène qui provient d'un phage qui s'est intégré au génome de ces bactéries au cours de l'évolution 39
modifier Variation génétique Les bactéries sont des organismes asexués, après la division bactérienne, les cellules filles héritent d'une copie identique du génome de leur parent.
Cependant, toutes les bactéries sont capables d'évoluer par modification de leur matériel génétique causé par des recombinaisons génétiques ou des mutations.
Les mutations (changements plus ou moins ponctuels et aléatoires de l'information génétique d'une cellule) proviennent d'erreur durant la réplication de l'ADN
Il existe 3 mécanismes de transfert de gènes entre les cellules: la transformation, la transduction,
L'ADN étranger peut être intégré dans le génome et être transmis aux générations suivantes. Cette acquisition de gènes, provenant d'une bactérie ou de l'environnement
est appelé transfert horizontal de gènes (HGT pour horizontal gene transfer) 41. Le transfert de gènes est particulièrement important dans les mécanismes de résistance aux antibiotiques 42
modifier Morphologie et association des bactéries Les bactéries présentent une grande diversité de morphologies et d'arrangements cellulaires
Les bactéries présentent une grande diversité de tailles et de formes. Les cellules bactériennes typiques ont comprise une taille entre 0, 5 et 5 m de longueur,
Les scientifiques peuvent déterminer la fonction de gènes, d'enzymes ou identifier des voies métaboliques nécessaires à la compréhension fondamentale du vivant
modifier Classification phénotypique Critères morphologiques (forme et groupement des bactéries, présence ou absence de flagelle, nature de la paroi, type de mobilité, présence d'endospore.
Cette technique permet de comparer la totalité du génome bactérien et d'estimer le degré d'homologie entre deux bactéries.
Séquençage des ARN ribosomiques ou séquençage des gènes codant les ARNR. Chez les procaryotes, la comparaison de la séquence en nucléotides de l'ARN 16s permet d'évaluer le degré de parenté entre ces organismes.
Ces gènes sont qualifiés d'horloge moléculaire et permettent la classification phylogénétique. modifier Identification des espèces bactériennes
La détermination génétique des espèces se base sur l'étude des gènes des ARN ribosomiques.
Le choix des gènes des ARNR 16s se justifie pour les raisons suivantes les ARNR 16s sont des molécules ubiquistes;
Il en résulte une évolution très lente de ces gènes. Le choix des gènes des ARNR plutôt que les ARNR eux-mêmes se base sur le choix de la technique de l'amplification par PCR.
Cette technique permet, à partir d'une colonie de bactéries, d'obtenir des fragments d'ADN correspondants au gène ou à une partie du gène.
Les analyses génétiques concernent également la région intergénique 16s-23s des opérons des ARN ribosomiques.
Tous les micro-organismes possèdent au moins une copie des gènes codant les ARN ribosomiques. Ces molécules sont indispensables à la synthèse des protéines, raison pour
Puis des amorces reconnaissant des zones très conservées du gène permettent d'amplifier par PCR une grande partie du gène ARNR 16s,
Les séquences du gène codant l'ARNR 16s sont connues pour plus de 4 000 souches bactériennes.
%Comme les gènes de la région intergénique 16s-23s sont conservés moins, ils diffèrent d'une souche à l'autre aussi bien au niveau de la séquence que de la longueur.
Ceci résulte de ce que de nombreuses bactéries ont des copies multiples par génome de l'opéron de l'ARNR,
Comme pour le gène de l'ARNR 16s, l'étude systématique de la région intergénique 16s-23s requiert l'amplification de cette région par PCR.
The 160-kilobase genome of the bacterial endosymbiont Carsonella. Science 314 (5797): 267#Pradella S, Hans A, Spröer C, Reichenbach H, Gerth K, Beyer S (2002.
ultramicrobactérie Structure bactérienne Archaea Écologie microbienne Biofilm Liste de bactéries importantes sur le plan clinique Duplication génique chez les bactéries Symbiose Microbiote Interactions durables Hygiène Fomite
Dans le système WZ de détermination sexuelle, les femelles ont deux chromosomes sexuels de types différents (WZ),
alors que les mâles ont deux chromosomes sexuels de même type (ZZ). Cependant le schéma général de détermination des sexes est connu mal
Le génome des oiseaux est original sur plusieurs points, la taille physique du génome est faible parmi les vertébrés et de 2 à 8 fois plus courte que chez les mammifères 13.
Le génome est assez homogène avec 60 à 75%de séquences uniques 13. La gamme de variations du nombre diploïde est étendue assez:
de 40 pour l'oedicnème criard (Burhinus oedicnemus) à 138 pour le martin-pêcheur (Alcedo atthis) 13 avec une distribution de type gaussien avec un maximum vers 85
Une des caractéristiques génétiques majeure et originale du génome avien est l'hétérogénéité de tailles des chromosomes.
Le rapport entre le plus court et le plus long chromosome est de 1 pour 35 chez la poule domestique et de 1 à 15 chez les Accipitridae 14.
constituent des éléments majeurs du génome 15 Les éleveurs d'oiseaux sont particulièrement attentifs à la génétique de leurs oiseaux pour essayer de faire exprimer certains allèles visibles qui augmentent la valeur de ceux-ci.
Cette pratique est courante pour de nombreux passereaux exotiques et les Psittacidae chez qui les éleveurs sélectionnent des couleurs insolites,
À second toxic bird genus (Ifrita kowaldi) from New guinea, dans PNAS, vol. 97, n o 24,21 novembre 2000, p. 12970-12975 résumé, pdf
. Daly, Homobatrachotoxin in the genus Pitohui: chemical defense in birds? dans Science magazine, vol. 258, n o 5083,30 octobre 1992, p. 799-801 résumé, pdf texte intégral (pages consultées le 16 février 2010.
que le cadmium a la capacité de modifier le matériel génétique, en particulier les chromosomes. D'après le directeur du centre de recherche de la fondation"vive la santé"le cadmium serait un des facteurs de stérilité
Cependant, les chloroplastes de Vaucheria litorea ont transféré une grande partie de leurs gènes nécessaires à la photosynthèse vers le noyau de cette algue au cours de l'évolution 16.
néanmoins chez la limace de mer grâce au transfert d'un gène nécessaire à la photosynthèse du noyau de l'algue vers celui de la limace 16
. Tyler, Debanish Bhattacharya, Ahmed Moustafa et James R. Manhart, Horizontal gene transfer of the algal nuclear gene psbo to the photosynthetic
Cette notion récente évoque la bonne transmission du patrimoine génétique d'une génération à l'autre.
Elle passe par la qualité du génome, des spermatozoïdes et des ovules, mais aussi par une maternité sans risque, l'absence de violences sexuelles et sexistes, l'absence de maladies sexuellement transmissibles (MST), la planification familiale, l'éducation sexuelle, l'accès aux soins, la diminution de l'exposition aux perturbateurs endocriniens, etc
bêta Radioactivité gamma Radiotoxicologie Elaphomyces granulatus (champignon bioaccumulateur et bioconcentrateur, à l'origine de la contamination de sangliers) Cassure chromosomique Organisme radiorésistant Agence nationale pour la gestion des déchets radioactifs
François Jacob, David Perrin, Carmen Sanchez et Jacques Monod proposent le concept d'opéron pour le contrôle de l'expression des gènes bactériens. 1977:
Séquençage complet du premier génome bactérien (Haemophilus influenzae) par Craig Venter et ses collègues du TIGR.
la PCR (Polymerase Chain Reaction) pour cibler un gène présent uniquement chez une famille ou un genre bactérien par réhybridation spécifique de courtes séquences d'ADN (oligonucléotides amorces) synthétiques précises. les puces à ADN
notamment parce que le malade a le temps de s'habituer à la gène respiratoire et perd progressivement la notion de"normalité"respiratoire, jusqu'à
que la fumée de tabac modifie les gènes de cellules pulmonaires de souris, et pourrait causer des changements génétiques dans les poumons des foetus,
un des chercheurs sur l'asthme en Grande-bretagne, a publié dans le journal Nature les résultats d'une recherche de cinq ans mettant en cause le gène ADAM33.
Ceci est le premier gène découvert pour l'asthme, et contrôlerait la façon dont le muscle se développe dans les voies respiratoires. Holgate pense également que les facteurs environnementaux pourraient influencer les choses bien plus tôt
ils pourraient influencer l'expression des gènes dans le développement du foetus, contribuant ainsi à une modification génétique favorisant la maladie.
Holgate et son équipe ont démontré déjà la modification du gène ADAM33 par la fumée de tabac dans des cultures de tissu pulmonaire de souris.
Or le gène ADAM33, impliqué dans l'asthme, se comporte de façon très similaire au gène ADAM17 responsable de la production de TNF alpha.
On trouve aussi cette molécule TNF alpha dans les tissus enflammés des patients souffrant d'autres maladies respiratoires chroniques
D'autres gènes sont corrélés à la maladie asthmatique. Une mutation du gène codant la protéine YKL-40 (une chitinase) augmente ainsi sensiblement le risque de développer un asthme 15
modifier Évaluation de la gravité d'une crise d'asthme Une crise d'asthme aiguë se caractérise par une exacerbation aiguë de la dyspnée, de la toux et du sifflement respiratoire,
et la Convention sur la biodiversité qui soumet l'utilisation du patrimoine génétique mondial à une série de conditions
et la Convention sur la biodiversité qui soumet l'utilisation du patrimoine génétique mondial à une série de conditions
et la Convention sur la biodiversité qui soumet l'utilisation du patrimoine génétique mondial à une série de conditions
au mieux elle le gène (il faut l'éliminer...au pire elles l'intoxiquent ou affectent ses capacités de reproduction ou celle de sa descendance (perturbateur endocrinien
qui ne disposent pas des gènes permettant à l'organisme de détoxiquer au mieux le cerveau du mercure et du plomb
qui peuvent se répliquer de façon indépendante par rapport au chromosome, mais non indépendamment de la cellule hôte.
Les relations de parasitisme entraînent la perte de nombreux gènes (notamment les gènes pour le métabolisme apportés par l'hôte.
qui se sont échappés du génome cellulaire pour devenir indépendants. Ce phénomène pourrait avoir eu lieu lors d'erreurs au cours de la réplication du matériel génétique.
et de se multiplier dans un génome). modifier Nature Il y a débat sur la nature des virus
le mimivirus, infectant une amibe, possède dans son génome 1 200 gènes (davantage que certaines bactéries.
Certains de ces gènes participeraient à la synthèse protéique et à des mécanismes de réparation de l'ADN 7. Il existe chez le mimivirus une trentaine de gènes présents habituellement chez les organismes cellulaires mais absents chez les virus. Le virus ATV d'archées présente lui aussi des caractéristiques étonnantes:
ce virus en forme de citron présente la particularité de se modifier en dehors du contexte cellulaire par un mécanisme actif.
D'après Patrick Forterre, le premier organisme à ADN serait un virus. L'ADN conférerait au virus le pouvoir de résister à des enzymes dégradant les génomes à ARN
Transfert horizontal de gènes Les virus ont un rôle naturel important de véhicule pour le transfert de gênes entre des espèces différentes,
Les génomes des virus ne comportent que de quelques gènes à 1 200 gènes. Le plus petit virus connu est le virus delta,
Il ne comporte qu'un seul gène. Le plus gros virus connu est le mimivirus
avec un diamètre qui atteint 400 nanomètres et un génome qui comporte 1 200 gènes
modifier Acide nucléique Article détaillé: Acide nucléique Le filament d'acide nucléique peut être de l'ADN ou de l'ARN.
Il représente le génome viral. Il peut être circulaire ou linéaire, bicaténaire (double brin) ou monocaténaire (simple brin.
Le génome sous forme d'ADN est généralement bicaténaire. Le génome sous forme d'ARN est généralement monocaténaire
et peut être à polarité positive (dans le même sens qu'un ARN MESSAGER) ou à polarité négative (complémentaire d'un ARN MESSAGER).
qui peut posséder des protéines codées par le génome viral ou le génome de l'hôte.
C'est l'interaction du génome viral et de la cellule hôte qui aboutit à la production de nouvelles particules virales.
grâce à des récepteurs spécifiques Pénétration dans la cellule Décapsidation (libération de l'acide nucléique) Réplication du génome viral Synthèse de protéines virales Assemblage et encapsidation des particules virales produites Libération des virions hors de la cellule-hôte
Les virus sont classifiés selon la nature de l'acide nucléique de leur génome (ADN ou ARN), la structure de l'acide nucléique (monocaténaire ou bicaténaire), la forme de l'acide nucléique (linéaire,
La majorité ont composé un génome d'ARN. Les virus de végétaux peuvent être disséminés par le vent ou par des vecteurs comme les insectes et les nématodes, parfois par les graines et le pollen.
aussi en biologie moléculaire pour exprimer un gène étranger (protéine recombinante) dans des cultures de cellules d'insecte.
Son génome peut cependant subsister sous la forme d'un épisome libre ou intégré au génome cellulaire.
Il y a transformation cellulaire virale lorsque le génome du virus entre en interaction avec l'ADN du génome cellulaire.
On appelle ces virus des virus oncogènes. Parmi ceux-ci, les rétrovirus, en s'intégrant dans le génome cellulaire,
peuvent devenir tumorigène et possèdent donc la capacité d'entraîner des cancers La classification des principaux groupes de virus et leur correspondance en pathologie, se trouve dans l'encyclopédie médicale Vulgaris. Elle est basée sur le type de molécule d'acides nucléiques (ARN ou ADN)
Les virus peuvent de plus être utilisés comme vecteur pour introduire un gène dans une cellule.
ou pour étudier l'effet de l'introduction du nouveau gène dans le génome. Certains virus sont utilisés en thérapie génique comme vecteur,
pour soigner diverses maladies. Dans certaines maladies génétiques, un gène défectueux provoque les symptômes. Les virus vecteur permettraient de cibler des cellules spécifiques
et remplacer le gène en question par un gène normal. Les virus sont utilisés également dans la lutte contre le cancer.
Certains virus sont capables de détruire spécifiquement des cellules cancéreuses modifier Notes et références #Le pluriel latin de virus n'est connu pas.
1. 2-megabase genome sequence of Mimivirus, Science, 2004 Nov 19; 306 (5700): 1344-50.#
three DNA viruses to replicate their genomes: à hypothesis for the origin of cellular domain, PNAS, vol. 103 (10), pp. 3669-3674,2006#Ali Saïb, Les virus, inertes ou vivants?
Phage as agents of lateral gene transfer, Curr. Opin. Microbiol. volume 6, issue 4, pages 417#24 (Août 2003), pmid 12941415, doi 10.1016/S1369-5274 (03) 00086-9#Forterre P
1 Historique 2 Exemples de biens communs 2. 1 Bien commun et génome 3 Bien commun et économie 3. 1 Notes et références 4 Voir aussi 4. 1
Les logiciels, les médicaments, les gènes, les semences agricoles font l'objet d'une lutte entre ceux
modifier Bien commun et génome La biodiversité, autrement dit la complexité naturelle du vivant est partie en identifiable
en détaillant le patrimoine génétique des êtres vivants John Sulston, Prix nobel de médecine 2002 apportent un éclairage sur la relation entre bien commun et génome
Mais la séquence du génome est découverte une, pas une invention. Comme une montagne ou un torrent, c'est un objet naturel
qui existait déjà, pas avant nous, certes, mais avant que nous nous rendions compte de sa présence.
De plus il existe aussi des niveaux de sensibilités liés au patrimoine génétique, à l'état général de santé, à l'histoire immunitaire,
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