Virus

Adénovirus (8)
Arenavirus (42)
Bactériophage (15)
Virus des plantes (5)

Sommaire : Animaux et végétaux: Micro-organismes: Virus:


http://fr.wikipedia.org/wiki/Environnement

on désigne sous ce terme les pollutions par les virus, bactéries et parasites. Principalement contenus dans les excréments, ces germes peuvent provoquer des maladies graves pour ceux

L'eau et l'air peuvent être vecteurs de produits toxiques, CMR, non-biodégradables, allergisants ou eutrophisants mais aussi de virus,


http://fr.wikipedia.org/wiki/Pollution_atmosph%C3%A9rique

) de poussière (provenant de l'érosion des sols ou d'activité volcanique), de particules d'origine biologique pollen, virus, bactéries, spores, excréments d'acariens..(


http://fr.wikipedia.org/wiki/%C3%89cologie

-Écologie sociale-Écologie des sols-Écologie des systèmes-Écologie ergomotrice-Écologie théorique-Écologie tropicale-Écologie urbaine-Écologie végétale-Écologie virale-Écologie du paysage


http://fr.wikipedia.org/wiki/Pollution_marine

Devenir des virus entériques humains en milieu marin: Apport des VLP (Virus Like Particles) pour la purification des coquillages, 5 novembre 2004 Page d'Ifremer"Pollution marine"modifier Notes et références

#Section 2 (Protection et préservation du milieu marin; Sous-section 1 (Principes et dispositions générales) de la Loi Grenelle II (voir p. 189/308)# Joint Group of Experts on the Scientific Aspects of Marine Environmental Protection;


http://fr.wikipedia.org/wiki/For%C3%AAt

maladies véhiculées par les tiques, apparition du SIDA ou de virus hémorragiques, type Ebola, etc.),


http://fr.wikipedia.org/wiki/Station_d%27%C3%A9puration

mais elles ne peuvent généralement traiter correctement les nitrates et/ou les phosphate, ni certains types de virus ou bactéries,


http://fr.wikipedia.org/wiki/Biodiversit%C3%A9

Certains groupes (virus, bactéries, lichens, pico et nanoplancton, micro-invertébrés..sont très mal connus: ils forment

Virus 5 000 500 000 500 000 Bactéries 4 000 3 000 000 400 000 note 4


http://fr.wikipedia.org/wiki/Pollution

Elle intègre la pollution biologique induite par des taux anormaux ou anormalement allergènes de microbes, virus, pollens ou de spores fongiques.


http://fr.wikipedia.org/wiki/Parc_national

Quand un virus menaça de disparition des lions du Serengeti, la décision de ne pas intervenir fut maintenue,


http://fr.wikipedia.org/wiki/Sant%C3%A9-Environnement

Des virus très pathogènes et à potentiel élevé de pandémie VIH/SIDA, Syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS), virus de la fièvre du Nil occidental, virus Ebola, H5n1, etc


http://fr.wikipedia.org/wiki/Bacteria

la disponibilité en nutriments, la présence de bactéries concurrentes, la présence de prédateurs (par exemple des paramécies), la présence de bactériophages, la présence d'antibiotiques (inhibant par exemple la synthèse de la paroi bactérienne, entraînant donc leur mort) produits par des champignons ou des actinomycètes

d'autre part intégrer de l'ADN de virus bactérien (bactériophage). Ces bactériophages peuvent contribuer au phénotype de l'hôte 38.

Par exemple, les bactéries Clostridium botulinum et Escherichia coli o157: H7 synthétisent une toxine codée par un gène qui provient d'un phage

alors qu'au cours de la transduction, le transfert d'ADN a lieu par l'intermédiaire d'un bactériophage.

soit une taille comparable à certains gros virus 44 La plupart des bactéries sont appelées soit sphériques

Elle comprend des bactéries, des champignons, des protozoaires, des algues, des virus, mais les bactéries sont les représentants les plus importants quantitativement.

#en) O'brien S, Goedert J, HIV causes AIDS: Koch's postulates fulfilled, dans Curr Opin Immunol, vol. 8, n o 5, 1996, p. 613#618 lien PMID, lien DOI#(en) The


http://fr.wikipedia.org/wiki/Biosph%C3%A8re

et d'archées et de virus marins adaptés à la vie en condition extrêmes Un programme international de recherche 1, soutenu par L'union européenne,


http://fr.wikipedia.org/wiki/Oiseau

West Nile Virus, Lyme Disease, Influenza A and Enteropathogens, dans Clin Med Res, vol. 1, n o 1, 2003, p. 5#12 résumé.#


http://fr.wikipedia.org/wiki/Qualit%C3%A9_de_l%27eau

On peut distinguer les contaminants inertes des contaminants biologiques (bactéries, virus, etc. qui peuvent se reproduire,


http://fr.wikipedia.org/wiki/Sant%C3%A9

traitement des infections génitales, maladies sexuellement transmissibles y compris le VIH/SIDA; le cancer du sein et les cancers génitaux,


http://fr.wikipedia.org/wiki/Traitement_de_l%27air

les virus et bactéries qui forment la pollution microbienne et sont la source de maladies (grippe, maladie virale, etc...

d'infections et de problèmes de reproduction. Article détaillé: Pollution bactérienne les allergènes tels que la poussière, les pollens, les spores de moisissures, poils d'animaux, sources principales des allergies, de l'asthme et autres difficultés respiratoires Article détaillé:

Ces types de pollution domestiques entrainent maladies virales, cancers, infections, difficultés respiratoires et allergies, le traitement de l'air est


http://fr.wikipedia.org/wiki/Excr%C3%A9ment

Les selles sont potentiellement porteuses de parasites (vers) et/ou de virus et germes de maladies dangereuses et/ou contagieuses dits fécaux (éventuellement thermorésistant.

de même que certains risques sanitaires (prion, virus de type grippe aviaire ou autre). De nombreuses expériences d'épandage en forêt ont été également faites dans le monde, généralement limitées en raison des risques sanitaires via les cueillettes de champignons, de baies ou via le gibier


http://fr.wikipedia.org/wiki/Microbiologique

Les virus, incapables de se reproduire sans détourner la machinerie cellulaire d'un autre organisme,

ainsi que la vaccination (connue depuis Edward Jenner pour la variole-maladie virale). 1873-1882: Robert Koch met en évidence le bacille responsable de la tuberculose (Mycobacterium tuberculosis).

Découverte des bactériophages par Frederick Twort et Félix d'Hérelle. 1928: Frederick Griffith découvre la transformation bactérienne


http://fr.wikipedia.org/wiki/Agriculture_intensive

ou dispersion de virus tels que le H5n1. Les agriculteurs sont cependant souvent également des victimes de crises liées à l'industrialisation,


http://fr.wikipedia.org/wiki/Objectifs_du_mill%C3%A9naire_pour_le_d%C3%A9veloppement

combattre le VIH/SIDA, le paludisme et les autres maladies 1. 7 Objectif 7: assurer un environnement humain durable 1. 8 Objectif 8:

et l'autonomisation des femmes. 4. Réduire la mortalité infantile. 5. Améliorer la santé maternelle. 6. Combattre le VIH/SIDA,

combattre le VIH/SIDA, le paludisme et les autres maladies Chaque jour, près de 7 500 personnes sont contaminés par le VIH

et 5 500 meurent du SIDA. En 2007,33 millions de personnes vivaient avec le VIH/SIDA, un chiffre en hausse depuis 2001,

et qui concernent avant tout l'Afrique subsaharienne. Le paludisme (aussi appelé la malaria) tue plus d'un million de personnes par an,

Cible 1 Endiguer voire faire reculer la pandémie du VIH et du SIDA. Si les traitements antirétroviraux ont réussi à faire baisser le nombre de nouveaux contaminés par le VIH

et à faire réduire le nombre de décès dus au SIDA, la durée de vie prolongée des personnes infectées par le HIV fait

que le nombre total de contaminés a augmenté, de 29,5 millions en 2001 à 33 millions en 2007.

de plus en plus de femmes sont porteuses du virus Cible 2 Rendre accessible à tous d'ici 2010 les traitements disponibles contre le VIH et le SIDA.

Les antirétroviraux ont allongé l'espérance de vie des malades, mais il existe toujours un fossé entre le nombre de personnes en attente de ce type de traitement et le nombre de traitements disponibles. ainsi en Amérique latine,


http://fr.wikipedia.org/wiki/%C3%8Atres_vivants

les virus ne grandissent pas et n'ont pas d'activité métabolique, mais certains les considèrent comme vivants

les virus et les prions. Cependant, ces entités partagent avec les organismes vivants la capacité de se répliquer,

même si en pratique seuls les objets en marge sont sujet à discussion (les microbes, les virus,


http://fr.wikipedia.org/wiki/Catastrophe_environnementale

Déforestation massive dans diverses régions du monde, Dégradation graduelle d'îles du Pacifique due à l'extraction intensive de phosphate, spécialement Banaba et Nauru réf. nécessaire Diffusion du virus du poulet (grippe aviaire


http://fr.wikipedia.org/wiki/Catastrophe_%C3%A9cologique

Déforestation massive dans diverses régions du monde, Dégradation graduelle d'îles du Pacifique due à l'extraction intensive de phosphate, spécialement Banaba et Nauru réf. nécessaire Diffusion du virus du poulet (grippe aviaire


http://fr.wikipedia.org/wiki/Ultrafiltration

virus, germes et grosses molécules organiques), laissant filtrer à l'arrivée une eau parfaitement clarifiée


http://fr.wikipedia.org/wiki/%C3%89levage

qui semblent avoir eu un rôle dans la diffusion du virus H5n1 et d'autres pathogènes),


http://fr.wikipedia.org/wiki/Pays_en_voie_de_d%C3%A9veloppement

, le développement durable, le combat contre le VIH, l'amélioration de la santé maternelle, la réduction de la mortalité infantile,


http://fr.wikipedia.org/wiki/Virus

Virus-Wikipédia Virus Un article de Wikipédia, l'encyclopédie libre Aller à: Navigation, rechercher Pour les articles homonymes, voir Virus (homonymie

Virus Rotavirus Classification des virus Type Virus Groupes de rang inférieur Groupe I (dsdna) Groupe II (ssdna) Groupe III (dsrna) Groupe IV((+ssrna) Groupe V((-ssrna) Groupe VI (ssrna-RT) Groupe

VII (dsdna-RT Un virus est une entité biologique qui nécessite une cellule hôte, dont il utilise les constituants pour se multiplier.

Les virus existent sous une forme extracellulaire ou intracellulaire. Sous la forme intracellulaire (à l'intérieur de la cellule hôte), les virus sont des éléments génétiques

qui peuvent se répliquer de façon indépendante par rapport au chromosome, mais non indépendamment de la cellule hôte.

Sous la forme extracellulaire, les virus sont des objets particulaires, infectieux, constitués au minimum d'un acide nucléique et de protéines.

Le débat sur la nature des virus (vivants ou pas) repose sur des notions complexes et reste aujourd'hui ouvert

La virologie est la science qui étudie les virus. Elle est étudiée par des virologues ou virologistes

Le mot virus est issu du latin virus, i qui signifie poison. Se terminant par un s,

il ne prend pas de marque particulière au pluriel en français 1 Sommaire 1 Caractéristiques 2 Découverte 3 Origine et nature 3. 1 Origine 3. 2 Nature 4 Rôle dans l'évolution 5 Structure 5. 1

Acide nucléique 5. 2 Capside 5. 3 Enveloppe 6 Reproduction 6. 1 Multiplication virale 6. 2 Culture des virus 7 Typologie 7

. 1 Classification 7. 2 Virus des procaryotes 7. 3 Virus des plantes 7. 4 Virus des insectes 7. 5 Virus des champignons 7. 6 Virus

chez l'Homme 7. 6. 1 Virus et maladie 7. 6. 2 Exemples de virus pathogènes pour l'Homme 8 Prévention et traitement 9 Application 10 Notes

et références 11 Annexes 11.1 Bibliographie 11.2 Articles connexes 11.3 Liens externes modifier Caractéristiques Structure de base d'un virus

Un virus se caractérise par son incapacité à se multiplier seul par division. Il a besoin pour cela d'utiliser une cellule hôte:

un virus est un parasite intracellulaire obligatoire. Il est composé d'une ou plusieurs molécules d'acide nucléique (soit d'ADN,

soit d'ARN, simple ou double brin) entourées d'une coque de protéines, appelée la capside,

et, parfois, d'une enveloppe. Il ne possède en général aucune enzyme pouvant produire de l'énergie.

Les virus sont, le plus souvent, de très petite taille (comparée à celle d'une bactérie, par exemple), en règle générale inférieure à 250 nanomètres;

toutefois, le mimivirus a une taille de 400 nm, ce qui le rend plus gros que les plus petites bactéries.

Ce dernier a aussi la particularité de posséder à la fois de l'ADN et de l'ARN

La forme libre du virus (ou particule virale) s'appelle le virion Tous les êtres vivants peuvent être infectés par des virus. Il existe des virus de bactéries (les bactériophages), des virus d'Archaea, des virus d'algues (Phycodnaviridae), des virus de plantes, des virus fongiques, des virus d'invertébrés, des virus de vertébrés, parmi

lesquels on trouve de nombreux agents pathogènes, et même des virus de virus 2 modifier Découverte

Dès la fin du XIX e siècle, les scientifiques isolèrent des agents infectieux, invisibles au microscope optique,

d'autres les qualifiaient de virus filtrants ou virus ultrafiltrants. Vers 1925, la définition d'un virus 3 était devenue un agent responsable d'une maladie infectieuse, parasite, de nature particulaire et de taille comprise entre 0. 01 et 0. 3 microns 4

À la fin du XIX e siècle, la conception d'agents infectieux qui n'étaient ni des bactéries, ni des champignons,

'À la même époque, le virus de la fièvre aphteuse est le premier virus identifié par Friedrich Löffler et Paul Frosch.

Le virus de la fièvre jaune est le premier virus pathogène de l'Homme identifié entre 1900 et 1902

Ce phénomène est dû à un virus de bactéries que Félix d'Hérelle baptisa bactériophage. Les virus des plantes, des animaux, de l'Homme et des bactéries étaient découverts ainsi

et leurs listes ne cessèrent de s'allonger au cours du XX e siècle. L'apparition de la microscopie électronique dans les années 1930 permit l'observation des virus

mais on ne savait toujours pas à cette époque ce qu'ils étaient réellement Le biochimiste américain Wendell Stanley cristallisa le virus de la mosaïque du tabac sous forme de cristal protéique en 1935.

L'année suivante, des études complémentaires montrèrent que ce cristal contenait également de l'ARN.

Les études ultérieures montrèrent que selon les virus étudiés, ceux-ci étaient composés soit de protéines et d'ARN,

soit de protéines et d'ADN. C'est en 1957 qu'André Lwoff proposa une définition claire et moderne des virus

À partir des années 1960, le développement des cultures cellulaires, de la microscopie électronique, puis de la biologie moléculaire permit aux scientifiques de progresser dans la compréhension des mécanismes de réplication des virus, dans la réalisation de diagnostics fiables et dans l'élaboration de vaccins

modifier Origine et nature Les maladies virales comme la rage, la fièvre jaune, la variole, affectent les humains depuis des siècles.

Des hiéroglyphes mettent en évidence la poliomyélite dans l'Égypte antique, les écrits de l'Antiquité gréco-romaine et d'Extrême-orient décrivent certaines maladies virales

modifier Origine Il existe plusieurs hypothèses concernant l'origine et l'évolution des virus. Il est probable

que tous les virus ne dérivent pas d'un ancêtre commun et les différents virus peuvent avoir des origines différentes

Les virus et les cellules ont pu apparaître dans la soupe primordiale en même temps et évoluer parallèlement.

Dans ce scénario, au début de l'apparition de la vie, les plus anciens systèmes génétiques d'auto-réplication (probablement de l'ARN) sont devenus plus complexes

et se sont enveloppés dans un sac lipidique pour aboutir au progénote à l'origine des cellules. Une autre forme réplicative aurait pu garder sa simplicité pour former des particules virales.

Les virus pourraient dériver de cellules ayant subi une régression. D'après cette hypothèse, les ancêtres des virus auraient été des êtres vivants libres

ou des micro-organismes devenus des prédateurs ou des parasites dépendants de leur hôte. Les relations de parasitisme entraînent la perte de nombreux gènes (notamment les gènes pour le métabolisme apportés par l'hôte.

Cet organisme aurait évolué co avec la cellule hôte et n'aurait conservé que sa capacité à répliquer son acide nucléique et le mécanisme de transfert de cellule à cellule.

et rappelant les virus. Les virus peuvent avoir pour origine des morceaux d'acides nucléiques qui se sont échappés du génome cellulaire pour devenir indépendants.

Les virus pourraient aussi avoir pour origine des plasmides (molécules d'ADN circulaires) ou des transposons (séquences d'ADN capables de se déplacer

Il y a débat sur la nature des virus Les virus possèdent des constituants en commun avec les cellules vivantes,

comme un acide nucléique (ADN ou ARN) et des protéines. Cependant, selon la définition du biochimiste Wendell Stanley, les virus sont de simples associations de molécules biologiques.

Ils sont le fruit d'une auto-organisation de molécules organiques et ne sont donc pas vivants.

François Jacob insiste aussi sur cette caractéristique des virus: placés en suspension dans un milieu de culture,

toutes fonctions communes aux êtres vivants 6. Les virus ne peuvent se multiplier qu 'en utilisant l'équipement enzymatique d'une cellule vivante.

De plus, les virus contiennent bien un acide nucléique, de l'ADN ou de l'ARN,

et à des mécanismes de réparation de l'ADN 7. Il existe chez le mimivirus une trentaine de gènes présents habituellement chez les organismes cellulaires mais absents chez les virus. Le virus ATV d'archées présente lui aussi des caractéristiques étonnantes:

ce virus en forme de citron présente la particularité de se modifier en dehors du contexte cellulaire par un mécanisme actif.

Les virus ont aussi un rôle dans l'évolution. Patrick Forterre avance même l'hypothèse que les virus seraient les inventeurs de l'ADN 9. À l'origine de la vie,

l'ARN dominait (hypothèse du monde à ARN) et assurait à la fois les fonctions de stockage et transmission de l'information génétique et de catalyse des réactions chimiques.

D'après Patrick Forterre, le premier organisme à ADN serait un virus. L'ADN conférerait au virus le pouvoir de résister à des enzymes dégradant les génomes à ARN

On retrouve le même principe chez des virus actuels, qui altèrent leur ADN pour résister à des enzymes produites par des bactéries infectées

Le débat entre le caractère vivant ou inerte des virus reste encore aujourd'hui ouvert. Répondre à cette question exige de répondre au préalable à une autre:

Les virus ont un rôle naturel important de véhicule pour le transfert de gênes entre des espèces différentes,

et permet de disséminer des innovations génétiques au delà de la descendance de l'individu porteur de cette mutation génétique. 11 On pense que les virus ont joués un rôle central dans les premiers temps de l'évolution, avant la diversification entre bactéries, archaea et eucaryotes et à l'époque du Dernier ancêtre commun universel

Les virus sont encore l'un des plus grand réservoir sur la Terre de diversité génétique inexplorée. 12

Une particule virale complète, appelé virion, est composée d'un filament d'acide nucléique, généralement stabilisé par des nucléoprotéines basiques, enfermé dans une coque protéique protectrice appelée capside.

La forme de la capside est à la base des différentes morphologies des virus. La taille des virus se situe entre 10 et 400 nm.

Les génomes des virus ne comportent que de quelques gènes à 1 200 gènes. Le plus petit virus connu est le virus delta,

qui parasite lui-même celui de l'Hépatite b. Il ne comporte qu'un seul gène. Le plus gros virus connu est le mimivirus

avec un diamètre qui atteint 400 nanomètres et un génome qui comporte 1 200 gènes

modifier Acide nucléique Article détaillé: Acide nucléique Le filament d'acide nucléique peut être de l'ADN ou de l'ARN.

Il représente le génome viral. Il peut être circulaire ou linéaire, bicaténaire (double brin) ou monocaténaire (simple brin.

qui entoure et protège l'acide nucléique viral. Elle est constituée par l'assemblage de structures protéiques.

L'ensemble capside et nucléoïde est nommé nucléocapside. La structure de la capside entraîne la forme du virus,

ce qui permet de distinguer deux groupes principaux de virus: les virus à symétrie icosaédrique et les virus à symétrie hélicoïdale

modifier Enveloppe De nombreux virus sont entourés d'une enveloppe (ou péplos) qui prend naissance au cours de la traversée des membranes cellulaires.

Sa constitution est complexe et présente un mélange d'éléments cellulaires et d'éléments d'origine virale.

On y trouve des protéines, des glucides et des lipides. Les virus possédant une enveloppe sont enveloppés les virus.

Les virus ne possédant pas d'enveloppe sont les virus nus Virus icosaédriques virions icosaédriques au microscope électronique

La capside icosaédrique entraîne une apparence sphérique du virus. Les protomères sont organisés en capsomères, disposés de manières régulières et géométriques.

Une capsomère, en forme d'anneau, est composée de cinq ou six protomères. Parmi les virus icosaédriques, les parvovirus ont formée une capside de 12 capsomères, les poliovirus 32 capsomères,

les papillomavirus 72 capsomères tandis que la capside des adénovirus est constituée de 252 capsomères Virus hélicoïdaux

Schéma d'une capside hélicoïdale Ces virus sont de longs cylindres (300 à 400 nm), creux,

composés d'un type de protomère enroulé en spirale hélicoïdale. Ils peuvent être rigide ou flexible.

Le matériel génétique est logé à l'intérieur du tube. Le virus de la mosaïque du tabac est un exemple de virus hélicoïdal très étudié

Virus enveloppés Schéma d'un virus enveloppé: le VIH En plus de la capside, certains virus sont capables de s'entourer d'une structure membranaire empruntée à la cellule hôte.

Cette enveloppe membranaire est composée d'une bicouche lipidique qui peut posséder des protéines codées par le génome viral ou le génome de l'hôte.

Cette enveloppe donne quelques avantages aux virions par rapport à ceux composés d'une capside seul, comme la protection vis-à-vis d'enzymes ou de composés chimiques.

Les virus enveloppés sont par contre plus fragiles dans l'environnement extérieur, sensibles aux détergents et à la dessiccation.

Les glycoprotéines, formant des spicules fonctionnent comme des récepteurs permettant de se fixer sur des cellules hôtes spécifiques.

Le virus de la grippe (famille des Orthomyxoviridae), le VIH, virus du sida (famille des Retroviridae), sont des exemples de virus enveloppés

Virus complexes Schéma d'un bactériophage Ces virus possèdent une capside symétrique qui n'est ni hélicoïdale, ni vraiment icosaédrique.

Les bactériophages comme le phage T4 d'Escherichia coli sont des virus complexes possédant une tête icosaédrique liée à une queue hélicoïdale

à laquelle sont attachés des poils et des fibres caudales. Le poxvirus (variole, vaccine) est aussi un exemple de virus complexe.

C'est le virus animal parmi les plus grands (250 à 350 nm de long sur 200 à 250 nm de large.

Certains virus se présentent sous formes bacillaires. C'est le cas du virus de la rage (famille des Rhabdoviridae) et du virus Ebola

modifier Reproduction modifier Multiplication virale Article détaillé: Réplication virale Les virus ne peuvent se multiplier qu'au sein de cellules vivantes, par réplication de leur acide nucléique.

C'est l'interaction du génome viral et de la cellule hôte qui aboutit à la production de nouvelles particules virales.

L'infection d'une cellule par un virus, puis la multiplication du virus peuvent se résumer en différentes étapes.

Toutefois, après pénétration du virus dans la cellule, ces étapes peuvent différer selon la nature du virus en question

et notamment selon qu'il s'agit d'un virus à ADN ou d'un virus à ARN

Adsorption du virus au contact de la membrane de la cellule infectée, grâce à des récepteurs spécifiques Pénétration dans la cellule Décapsidation (libération de l'acide nucléique) Réplication du génome viral Synthèse de protéines virales Assemblage et encapsidation des particules virales produites Libération des virions hors de la cellule-hôte

modifier Culture des virus Culture de virus: technique des plages de lyse Afin de mieux connaître leur biologie, leur multiplication,

leur cycle de reproduction et éventuellement afin de préparer des vaccins, il est nécessaire de cultiver les virus. Ceux-ci peuvent se multiplier uniquement au sein de cellules vivantes.

Les virus infectant les cellules eucaryotes sont cultivées sur des cultures de cellules obtenues à partir de tissus animaux ou végétaux.

Les cellules sont cultivées dans un récipient en verre ou en plastique, puis sont infectées par le virus étudié.

Les virus animaux peuvent aussi être cultivés sur oeufs embryonnés et parfois chez l'animal, lorsque la culture in vitro est impossible.

Les virus bactériens peuvent également être cultivés par inoculation d'une culture bactérienne sensible. Les virus de végétaux peuvent

aussi être cultivés sur des monocouches de tissus végétaux, des suspensions cellulaires ou sur des plantes entières

Les virus peuvent ensuite être quantifiés de différentes manières. Ils peuvent être comptés directement grâce à la microscopie électronique.

Dans le cas des virus bactériens, la technique des plaques (ou plages) est utilisée très pour évaluer le nombre de virus dans une suspension.

Une dilution de suspension virale est ajouté à une suspension bactérienne, puis l'ensemble est réparti dans des boîtes de Petri.

Après culture, des zones claires (plages) à la surface de la gélose sont la conséquence de la destruction d'une bactérie et des bactéries adjacentes par un virion

Les virus peuvent être purifiés grâce à diverses méthodes de biochimie (centrifugation différentielle, précipitation, dénaturation, digestion enzymatique

modifier Typologie modifier Classification Article détaillé: Classification des virus Les virus sont classifiés selon la nature de l'acide nucléique de leur génome (ADN ou ARN), la structure de l'acide nucléique (monocaténaire ou bicaténaire), la forme de l'acide nucléique (linéaire,

circulaire, segmenté ou non). Les données morphologiques peuvent également être prises en compte (présence ou absence d'enveloppe, symétrie de la capside.

Souvent, le sérogroupage est utilisé encore pour raffiner la définition des différences entre virus très proches

modifier Virus des procaryotes Il existe deux catégories de virus de procaryotes selon le type d'hôte

qu'ils parasitent. La première catégorie regroupe ceux qui infectent les bactéries et sont appelés bactériophages.

La deuxième catégorie regroupe ceux qui infectent les Archaea. Il existe quatre grands groupes morphologiques de virus de procaryotes

Les virus à symétrie binaire. Ce groupe représente près de 96%des virus de procaryotes

et correspond aux familles des Myoviridae, des Siphoviridae et des Podoviridae. Les virus à symétrie cubique avec une capside icosaédrique mais pas de queue comme les Microviridae.

Les virus à symétrie hélicoïdale qui ont une forme de filaments comme les Inoviridae comme le phage M13.

Les virus pléomorphes, sans capsides véritable mais possédant une enveloppe. Ce groupe rassemble six familles de virus

dont cinq regroupent des virus infectant seulement les archées. Certains virus d'archées sont pléomorphes,

alors que d'autres ont des formes de bouteilles, de citron, de fuseau 13. Les bactériophages possèdent un rôle dans les écosystèmes.

Par exemple, dans les écosystèmes aquatiques, ils participent au contrôle de l'abondance et de la diversité bactérienne. 14

modifier Virus des plantes Microscopie électronique de particules du virus de la mosaïque du tabac La structure des virus des plantes ou phytovirus, est similaire à celle des virus bactériens et animaux.

Beaucoup de virus végétaux se présentent sous la forme de minces et longues hélices. La majorité ont composé un génome d'ARN.

Les virus de végétaux peuvent être disséminés par le vent ou par des vecteurs comme les insectes et les nématodes, parfois par les graines et le pollen.

Les virus peuvent aussi contaminer la plante par l'intermédiaire d'une blessure ou d'une greffe.

Différents types de symptômes peuvent apparaître sur la plante infectée. Les virus peuvent provoquer des taches ou des flétrissements sur les feuilles et les fleurs.

Des tumeurs peuvent survenir sur les tiges ou les feuilles. Le virus de la mosaïque du tabac TMV ou tobamovirus) est un exemple très étudié de virus de végétaux

modifier Virus des insectes Les baculovirus sont des virus d'insectes très étudiés. Ils infectent principalement les lépidoptères.

La larve de l'insecte s'infecte en ingérant de la nourriture. À partir du tube digestif, l'infection peut se transmettre aux autres tissus.

L'utilisation de virus pathogènes d'invertébrés dans la lutte contre les insectes ravageurs des cultures et des forêts pourraient être l'un des moyens pour limiter

ou remplacer les insecticides chimiques. Les baculovirus sont utilisés aussi en biologie moléculaire pour exprimer un gène étranger (protéine recombinante) dans des cultures de cellules d'insecte.

Par ailleurs, certains virus de végétaux sont transmis par des invertébrés mais ne se multiplient pas chez ces vecteurs

modifier Virus des champignons Les virus des champignons sont particuliers car ils se propagent lors de la fusion cellulaire.

Il n'y a pas de virions extracellulaires. Chez les levures comme Saccharomyces, les virus sont transmis au moment du brassage cytoplasmique lors de la fusion cellulaire.

Les champignons filamenteux comme Penicillium ou le champignon de paris Agaricus bisporus peuvent également être infectés par des virus

. ce qui peut entraîner des problèmes lors de production. Il a été imaginé d'utiliser ces virus dans le cadre d'une lutte biologique contre des champignons pathogènes

modifier Virus chez l'Homme modifier Virus et maladie Virus Ebola Le rhume, la grippe, la varicelle, la rougeole, la mononucléose infectieuse sont des exemples de maladies humaines virales relativement courantes.

Des maladies plus sévères comme le SIDA, le SRAS, la grippe aviaire, la variole sont causées aussi par des virus. Le virus Ebola entraîne des fièvres hémorragiques.

La capacité d'un virus d'entraîner une maladie est décrite en termes de virulence Les virus possèdent différentes stratégies, différents mécanismes grâce

auxquels ils peuvent produire des maladies. Le virus pénètre dans une cellule hôte spécifique et prend le contrôle de ses fonctions normales.

Au niveau cellulaire, les effets cytopathogènes des virus peuvent entraîner divers effets néfastes. Les capacités de synthèse des protéines des cellules infectées peuvent être inhibées,

la chromatine est fragmentée par des enzymes virales. Des particules virales s'accumulent dans le cytoplasme

ou le noyau des cellules infectées. Les virus peuvent ensuite provoquer la lyse et la mort des cellules hôtes.

La lyse des cellules entraîne la libération des particules virales et permet la dissémination du virus

Lorsque le virus pénètre dans une cellule non permissive, il ne peut pas se multiplier.

Son génome peut cependant subsister sous la forme d'un épisome libre ou intégré au génome cellulaire.

Il y a transformation cellulaire virale lorsque le génome du virus entre en interaction avec l'ADN du génome cellulaire.

On appelle ces virus des virus oncogènes. Parmi ceux-ci, les rétrovirus, en s'intégrant dans le génome cellulaire,

peuvent devenir tumorigène et possèdent donc la capacité d'entraîner des cancers La classification des principaux groupes de virus et leur correspondance en pathologie, se trouve dans l'encyclopédie médicale Vulgaris. Elle est basée sur le type de molécule d'acides nucléiques (ARN ou ADN)

qui constitue la particule virale ou virion. 3 modifier Exemples de virus pathogènes pour l'Homme

VIH, virus du sida Rétrovirus Coxackie A virus Ebola Virus de la variole Virus de la grippe Virus de la fièvre jaune Virus du Nil occidental Cytomégalovirus Rotavirus Virus de l'Hépatite c Virus simien 40

ou SV40 modifier Prévention et traitement Le virus de la polio Étant donné que les virus utilisent la machinerie cellulaire de l'hôte pour se reproduire à l'intérieur même de la cellule,

il est difficile de les éliminer sans tuer la cellule hôte. Des médicaments antiviraux permettent

cependant de perturber la réplication du virus Une autre approche est la vaccination qui permet de résister à l'infection

Divers médicaments permettent de traiter les symptômes liés à l'infection. Les patients demandent souvent à leurs médecins qu'ils leurs prescrivent des antibiotiques,

mais ils sont sans effet sur les virus. Les antibiotiques interfèrent en effet avec des constituants ou le métabolisme des bactéries et permettent

donc de traiter seulement les maladies d'origine bactérienne et non les maladies d'origine virale

Diverses méthodes de désinfection in vitro permettent d'inactiver les virus (hypochlorite de sodium à 1%,éthanol à 70%,glutaraldéhyde à 2%,formaldéhyde

modifier Application Les virus sont importants pour l'étude de la biologie moléculaire et la biologie cellulaire,

car ils fournissent des systèmes simples qui peuvent être utilisés pour la manipulation et la compréhension des fonctions cellulaires.

Par exemple, les virus présentent en général un matériel génétique simplifié et aident à la compréhension des mécanismes moléculaires de la génétique comme la réplication de l'ADN, la transcription, les modifications post-transcriptionnels de l'ARN, la traduction, le transport des protéines et l'immunologie

Les virus peuvent de plus être utilisés comme vecteur pour introduire un gène dans une cellule.

Cet outil est utilisé par exemple pour permettre à la cellule de produire une protéine recombinante ou pour étudier l'effet de l'introduction du nouveau gène dans le génome.

Certains virus sont utilisés en thérapie génique comme vecteur, pour soigner diverses maladies. Dans certaines maladies génétiques, un gène défectueux provoque les symptômes.

Les virus vecteur permettraient de cibler des cellules spécifiques et remplacer le gène en question par un gène normal.

Les virus sont utilisés également dans la lutte contre le cancer. Certains virus sont capables de détruire spécifiquement des cellules cancéreuses

modifier Notes et références #Le pluriel latin de virus n'est connu pas. Bien que se terminant par"-us,

"on le considère comme un nom neutre de la 2 e déclinaison; son pluriel serait alors"vira".

"La forme"viri"est une faute grammaticale: c'est le pluriel des mots masculins de la 2 e déclinaison;"

"virii"est un barbarisme. En anglais, la marque du pluriel pour un mot se terminant par"s"est"-es";

"la forme"viruses"se retrouve d'ailleurs le plus souvent dans la littérature médicale et professionnelle.#

#découverte d'un virophage#La première mention du terme virus apparaît chez Virgile avec le sens de"liquide sanieux et purulent"1#http://hal. archives-ouvertes. fr/docs/00/04/59/36/PDF

/tel-00004194. pdf#Page 111 du livre Une histoire des microbes de Patrick Berche, 2007, ISBN 978-2-7420-0674-8#François Jacob,

Qu'est-ce que la vie? in La Vie, Université de tous les savoirs, Editions odile jacob, 2002.##Raoult D.,Audic S.,Robert C.,Abergel C.,Renesto P.,Ogata H.,La Scola B.,Suzan M.,Claverie J.-M.,The

1. 2-megabase genome sequence of Mimivirus, Science, 2004 Nov 19; 306 (5700): 1344-50.#

#M. Haring et al. Independant virus development outside a host, Nature, vol. 436, p. 1101-1102,2005#Patrick Forterre, Three RNA cells for ribosomal lineages and

three DNA viruses to replicate their genomes: à hypothesis for the origin of cellular domain, PNAS, vol. 103 (10), pp. 3669-3674,2006#Ali Saïb, Les virus, inertes ou vivants?

in Pour la Science, décembre 2006.##Canchaya C, Fournous G, Chibani-Chennoufi S, Dillmann ML, Brüssow H;

Phage as agents of lateral gene transfer, Curr. Opin. Microbiol. volume 6, issue 4, pages 417#24 (Août 2003), pmid 12941415, doi 10.1016/S1369-5274 (03) 00086-9#Forterre P

, Philippe H;""The last universal common ancestor (LUCA), simple or complex?""The Biological Bulletin, volume 196, issue 3, pages 373#5, 375#7, Juin 1999, pmid 11536914, doi 10.2307/1542973,2#Prangishvili

, D.,P. Forterre, and R. A. Garrett. 2006. Viruses of the Archaea: à unifying view.

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Viruses in Aquatic Ecosystems. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 64,69-114 modifier Annexes modifier Bibliographie Pierre Ardoin:

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Biosûreté. Maladie infectieuse. Classification des virus. Virus informatique. modifier Liens externes fr) Introduction à la virologie:

document élaboré par Laurent Roux (et réalisé par Daniel Scherly) de la faculté de médecine de l'université de Genève (Suisse).

Révision du 14/10/2005. fr) Généralités en virologie: notes de cours proposées par deux étudiants de la faculté de La rochelle (France). Version du 12/03/2003. fr) Principes actuels de classification des virus:

extraits de cours de microbiologie, par Anne Decoster et al. de la faculté libre de médecine de Lille (France). Version du 22/05/2002.

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